萝卜生吃发辣主要与其中含有的硫代葡萄糖苷类物质和芥子油苷酶有关。这类成分在咀嚼时发生酶解反应，产生具有辛辣味的异硫氰酸酯类化合物。
萝卜中的硫代葡萄糖苷是天然防御物质，在植物细胞受损时与芥子油苷酶接触反应。白萝卜、青萝卜等品种因该物质含量较高，生吃时辛辣感更强烈。低温环境种植的萝卜为抵御冻害会合成更多此类成分，辛辣味也随之增强。十字花科蔬菜普遍含有这类物质，但萝卜因水分充足且细胞结构疏松，酶解反应更迅速。
部分品种如樱桃萝卜因硫代葡萄糖苷含量低，生吃时几乎无辛辣感。经高温加热后，芥子油苷酶失去活性，无法催化辛辣物质生成，故熟萝卜口感温和。对辛辣敏感者可通过削皮、盐渍或快速焯水减少刺激，但会损失部分维生素C和活性酶。
日常食用生萝卜可保留更多维生素C和消化酶，但胃肠功能较弱者应控制摄入量。建议搭配少量蜂蜜或橄榄油缓解辛辣刺激，避免空腹食用。选择表皮光滑、掂量沉实的萝卜辛辣味相对较轻，春季采收的萝卜因水分充足辣味也较温和。
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