石榴表皮发黑可能是变质的表现，也可能是品种特性或外部损伤导致。新鲜石榴表皮通常为鲜红色或黄色，若出现大面积黑斑、软烂或异味则可能已腐败；部分特殊品种如黑石榴本身呈深紫色，而轻微磕碰导致的局部褐变通常不影响食用。
石榴表皮变黑与氧化反应密切相关。当石榴受到挤压或储存时间过长，果皮中的多酚类物质接触空气后会发生酶促褐变，形成深色斑点。这类情况通常仅影响外观，剥开后若果粒饱满透亮、无黏液渗出仍可食用。存放环境湿度过高会加速霉菌滋生，导致果皮出现绒毛状黑斑并蔓延至果肉，此时果实往往伴有酸腐味，需立即丢弃。
部分进口石榴品种如以色列黑宝石成熟后表皮呈深紫近黑色，属于正常现象。采摘时果柄处分泌的黏液干燥后也可能形成黑色块状物，用湿布擦拭即可去除。若无法判断变质与否，可切开观察果粒状态：变质石榴果肉发暗、汁液浑浊，且籽与果肉分离；新鲜石榴即使表皮有瑕疵，内部果粒依然晶莹剔透。
选购石榴时应选择表皮光滑、重量沉甸的果实，避免有明显擦伤或凹陷的个体。储存时建议用报纸包裹后置于阴凉通风处，或剥出果粒密封冷藏。若发现果肉变色变味，或老人、儿童及免疫力低下者食用前，建议丢弃以确保安全。日常可通过观察果蒂是否干枯、按压是否弹性来判断新鲜度，变质石榴可能含有霉菌毒素，不宜冒险食用。
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