腐烂水果建议直接丢弃，不可食用或简单切除霉变部分后继续食用。水果腐烂主要由霉菌污染、细菌繁殖、营养流失等因素引起，处理方式需避免二次污染。
腐烂水果的霉菌毒素可能扩散至未霉变部位，肉眼无法完全辨别。常见霉菌如展青霉素、赭曲霉毒素等耐高温且毒性强，普通清洗或加热无法彻底去除。家庭处理时需佩戴手套，将腐烂水果装入密封袋丢弃，避免汁液污染其他食物或容器。接触腐烂水果的刀具、砧板需用沸水烫洗或消毒液浸泡，防止交叉污染。
部分轻微碰伤但未霉变的水果可切除损伤部位后尽快食用，但需观察果肉是否变色变味。若水果出现酒味、酸败味或果肉软化流水，即使局部霉变不明显也应整颗丢弃。特殊情况下少量腐烂水果可用于堆肥，但需深埋并远离食用植物种植区，避免毒素通过土壤转移。
日常储存水果应分类存放，香蕉、苹果等易释放乙烯的水果需单独放置。定期检查库存水果状态，成熟度高的优先食用。购买时选择无磕碰、表皮完整的果实，冷藏保存可延缓腐烂速度。处理腐烂水果后需彻底洗手，儿童及免疫力低下者应避免接触霉变食物残渣。
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