乙肝目前不能完全治愈主要与病毒特性、免疫应答缺陷以及现有治疗手段的局限性有关。乙肝病毒可形成稳定的cccDNA长期潜伏于肝细胞核内，现有药物难以彻底清除；同时患者免疫系统对病毒的特异性免疫应答不足，导致病毒持续复制；当前抗病毒药物仅能抑制病毒复制而无法根除病毒库，且病毒易发生耐药突变。
乙肝病毒进入肝细胞后会释放环状共价闭合DNA，这种cccDNA能够长期稳定存在于细胞核中，成为病毒复制的模板。现有核苷类似物如恩替卡韦片、富马酸替诺福韦二吡呋酯片等虽能有效抑制病毒聚合酶活性，但无法清除肝细胞内的cccDNA库。当停药后，残留的cccDNA可能重新启动病毒复制程序，导致病情反弹。
慢性乙肝患者多存在免疫耐受现象，特异性T细胞反应低下或耗竭，无法有效识别和清除被感染的肝细胞。虽然干扰素α-2b注射液等免疫调节剂可增强免疫应答，但对已建立的免疫耐受状态改善有限。部分患者经长期抗病毒治疗后虽能实现功能性治愈，但肝细胞内仍可检测到微量病毒核酸。
病毒变异逃逸是另一重要因素。乙肝病毒逆转录酶缺乏校正功能，在长期抗病毒治疗中易产生耐药突变株。如拉米夫定片长期使用可导致YMDD基序变异，降低药物敏感性。即使采用强效低耐药屏障的联合用药方案，仍无法完全避免耐药风险。
病毒整合宿主基因组的现象进一步增加治愈难度。乙肝病毒DNA可与肝细胞基因组发生整合，这种整合的病毒DNA虽无复制能力，但仍可表达病毒蛋白如HBsAg。现有治疗手段无法靶向清除整合的病毒片段，导致血清学标志物持续阳性。
慢性乙肝患者需定期监测肝功能、病毒载量和肝脏弹性成像，避免饮酒及使用肝毒性药物。饮食应保证优质蛋白摄入，适量补充维生素B族和维生素E，限制高脂高糖饮食。接种甲肝疫苗可预防重叠感染，适度有氧运动有助于改善肝功能。出现乏力加重或黄疸应及时就医调整治疗方案。
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