南瓜打成汁后仍然保留大部分营养成分，但部分膳食纤维和维生素可能因氧化或过滤流失。南瓜汁含有丰富的β-胡萝卜素、钾、维生素C及少量膳食纤维，适合消化功能较弱的人群食用。
南瓜中的β-胡萝卜素具有脂溶性特征，在榨汁过程中几乎不会流失，进入人体后可转化为维生素A，有助于维护视力健康和皮肤黏膜完整性。钾元素在液体中溶解度高，榨汁后仍能完整保留，对调节血压和电解质平衡有积极作用。维生素C虽易氧化，但短时间内榨汁饮用仍可保留一定含量，搭配酸性水果如橙子共同榨汁能减少损耗。膳食纤维因机械粉碎和过滤可能减少，但保留果肉可缓解这一问题。
若采用高速破壁机长时间搅拌或榨汁后长时间放置，部分热敏性维生素如维生素B族和维生素C会逐渐分解。过滤后的澄清南瓜汁几乎不含膳食纤维，而带果肉的浑浊汁液能保留更多纤维素。高温灭菌的罐装南瓜汁可能因热处理导致部分水溶性维生素损失，但矿物质和胡萝卜素稳定性较高。特殊人群如糖尿病患者需注意控制摄入量，避免因去纤维化导致血糖波动过快。
建议选择新鲜南瓜现榨现饮，搭配牛奶或坚果提升脂溶性营养素吸收。保留果肉可增加饱腹感，适合减肥人群代餐。胃肠敏感者应少量多次饮用，避免过量摄入粗纤维刺激肠道。日常可将南瓜汁与燕麦、藜麦等粗粮搭配，平衡营养并延缓糖分吸收。长期储存的南瓜汁需冷藏并尽快饮用，或选择低温灭菌工艺的商用产品。
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